Návrh Školení

Úvod do programovacího jazyka Python

  • Proč Python?
  • Použití Python k práci s biologickými daty
  • Práce s iPython shellem
  • Váš první program
  • Psaní Python skriptů
  • Import modulů

Práce s proteinovými a RNA/DNA sekvencemi

  • Hledání motivů
  • Přepis a překlad in silico
  • Zpracování sekvenčního zarovnání

Analýza dat v různých biologických formátech

  • Analýza FASTA
  • Konverze datových formátů

Provádění biologických analýz

  • VÝBUCH
  • biologické webové služby

Práce s biologickými 3D strukturami pomocí Python

Python usnadňuje statistickou analýzu

Vizualizace dat

  • Vytváření pruhových a bodových grafů
  • Výpočet plochy pod křivkou (AUC)

Práce se soubory .xls a .csv

  • Import dat a export do MS Excel / OpenOffice Calc
  • Psaní souborů .xls a .csv

Použití Python k vytvoření kanálu pro automatizované zpracování dat

Požadavky

Základní biologické znalosti o sekvencích proteinů, RNA a DNA.

 28 hodiny

Počet účastníků


Price per participant

Reference (1)

Upcoming Courses

Související kategorie