Návrh Školení

Úvod do Fidži a ImageJ

  • Přehled Fidži a jeho aplikací ve vědeckém výzkumu
  • Pochopení architektury a pluginů ImageJ
  • Instalace a nastavení Fiji pro optimální výkon

Základní techniky zpracování obrazu

  • Pořizování snímků a formáty importu
  • Nastavení kontrastu, jasu a použití filtrů
  • Metody vrstvení a promítání obrazu

Pokročilí Image Analysis

  • Segmentační techniky: prahování a detekce hran
  • Počítání objektů a analýza částic v histologických vzorcích
  • Měření ploch, obvodů a dalších morfologických znaků

Práce s Biologickými vzorky

  • Zpracování snímků histologických tkání, krvinek a řas
  • Barevná dekonvoluce a analýza obarvených tkání
  • Časosběrná analýza a sledování pohybu buněk

Automatizace a přizpůsobení

  • Vytváření a spouštění maker pro opakující se úkoly
  • Použití zásuvných modulů Fidži pro specializované analýzy
  • Základní skriptování s ImageJ Macro Language (IJM)

Data Management a Hlášení

  • Export výsledků a generování reportů
  • Anotace obrázků a příprava dat k publikaci
  • Osvědčené postupy pro analýzu reprodukovatelného obrazu

Shrnutí a další kroky

Požadavky

  • Základní porozumění konceptům biologického zobrazování
  • Seznámení s mikroskopií a histologickými technikami
  • Základní počítačová gramotnost

Publikum

  • Výzkumníci v biotechnologii a environmentální toxikologii
  • Laboratorní technici pracující s histologickým a buněčným zobrazováním
  • Vědci zajímající se o kvantitativní analýzu obrazu
 14 hodiny

Počet účastníků


Price per participant

Upcoming Courses

Související kategorie