Návrh Školení

Úvod do Fiji a ImageJ

  • Přehled Fiji a jeho aplikací v vědeckém výzkumu
  • Pochopení architektury ImageJ a pluginů
  • Instalace a nastavení Fiji pro optimální výkon

Základní techniky zpracování obrázků

  • Úvod a import formátů obrázků
  • Ajustace kontrastu, jasu a aplikace filtrů
  • Zásuvání a projekční metody obrázků

Pokročilé Image Analysis

  • Techniky segmentace: práhování a detekce hran
  • Počítání objektů a analýza částic v histologických vzorcích
  • Měření ploch, obvodů a jiných morfologických charakteristik

Práce s Biologickými vzorky

  • Zpracování obrázků histologické tkáně, krveňových buněk a jater
  • Dekonvoluce barev a analýza natřených tkání
  • Analýza časových posloupností a stopování pohybu buněk

Automatizace a vlastní přizpůsobení

  • Vytváření a spouštění makr pro opakující se úlohy
  • Použití Fiji pluginů pro specializované analýzy
  • Základní skriptování pomocí ImageJ Macro Language (IJM)

Vyhodnocení a zpracování dat

  • Export výsledků a generování záznamů
  • Anotace obrázků a příprava dat pro publikaci
  • Nejlepší postupy pro opakovatelnou analýzu obrázků

Shrnutí a další kroky

Požadavky

  • Základní pochopení konceptů biologického zobrazení
  • Srozumění se stereomikroskopickými a histologickými technikami
  • Základní počítačová gramotnost

Cílová skupina

  • Výzkumníci v biotechnologii a environmentální toxikologii
  • Laboratorní technici pracující s histologickým a buněčným zobrazením
  • Vědci zajímající se o kvantitativní analýzu obrazů
 14 hodiny

Počet účastníků


Price per participant

Upcoming Courses

Související kategorie