Návrh Školení

Úvod do Fiji a ImageJ

  • Přehled Fiji a jeho aplikací ve vědeckém výzkumu
  • Porozumění architektuře ImageJ a doplňkům
  • Instalace a nastavení Fiji pro optimální výkon

Základní techniky zpracování obrazu

  • Získání a import formátů obrazů
  • Úprava kontrastu, jasu a aplikace filtrů
  • Zásobníkové metody a projekce obrazů

Pokročilá analýza obrazu

  • Segmentační techniky: prahování a detekce hran
  • Počítání objektů a analyzování částic v histologických vzorcích
  • Měření ploch, obvodů a dalších morfologických charakteristik

Práce s biologickými vzorky

  • Zpracování obrazů histologických tkání, krvekапу a řas
  • Dekonvolve barvy a analýza zbarvených tkání
  • Analýza času a sledování pohybu buněk

Automatizace a přizpůsobení

  • Vytváření a spouštění makroů pro opakující se úkoly
  • Použití doplňků Fiji pro specializované analýzy
  • Základní skriptování v ImageJ Macro Language (IJM)

Správa dat a reporty

  • Export výsledků a generování zpráv
  • Anotace obrazů a příprava dat pro publikaci
  • Osobní doporučení pro opakovatelnou analýzu obrazu

Shrnutí a další kroky

Požadavky

  • Základní znalost konceptů biologického zpracování obrazu
  • Odborné znalosti mikroskopie a histologických technik
  • Základní počítačová gramotnost

Cílová skupina

  • Výzkumníci v biotechnologii a environmetal toxikologii
  • Laboratorní technici pracující s histologickými a buněčnými obrazy
  • Vědci zajímající se o kvantitativní analýzu obrazů
 14 hodiny

Počet účastníků


Cena za účastníka

Nadcházející kurzy

Související kategorie